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微生物的自然强毒通过物理、化学方法处理和生物的连续继代，使其对原宿主动物丧失致病力或只引起轻微的亚临床反应，但仍保存良好的免疫原性的毒株或从自然界筛选的自然弱毒株，制备的疫苗。
1、弱毒疫苗。是对微生物的自然强毒通过物理、化学方法处理和生物的连续继代，使其对原宿主动物丧失致病力或只引起轻微的亚临床反应，但仍保存良好的免疫原性的毒株或从自然界筛选的自然弱毒株，制备的疫苗。弱毒活疫苗的优点是免疫效果好，免疫力坚强，免疫期长，对种母代接种可使仔代获得被动免疫。缺点是存在散毒和造成新疫源的问题。
2、灭活疫苗。又称死苗，是利用物理或化学的方法处理微生物，使其丧失感染性或毒性而保持有良好的免疫原性，而制成的疫苗。灭活疫苗的优点是安全，不返祖，不返强，便于储存运输，对母源抗体的干扰作用不敏感，易制成联苗和多价苗。缺点是不易产生局部粘膜免疫，引起细胞介导免疫能力较弱，用量大成本高，免疫途径必须注射，需免疫佐剂来增强免疫应答，产生保护力慢，2—3周后才能刺激机体产生免疫保护力。
3、代谢产物疫苗。是用细菌的代谢产物如毒素、酶等制成的疫苗，如破伤风毒素、白喉毒素和肉毒素等经福尔马林处理后成为毒素，类毒素是广泛应用的代谢产物疫苗。
4、亚单位疫苗。是用微生物经物理化学方法处理，去除其无效物质，提取其有效抗原部分(如细菌荚膜、鞭毛，病毒衣壳蛋白等)，制备的疫苗(如猪大肠杆菌菌毛疫苗)。
5、活载体疫苗。应用动物病毒弱毒或无毒株如痘苗病毒、疮疹病毒、腺病毒等作为载体，插入外源免疫抗原基因构建重组活病毒载体，转染病毒细胞而制备的疫苗。
6、基因缺失苗。应用基因操作，将病原细胞或病毒中与致病性有关物质的基因序列除去或失活，使之成为无毒株或弱毒株，但仍保持免疫原性。用这种无毒株或弱毒株做成的疫苗为基因缺失苗。
7、单价疫苗。利用同一种微生物菌(毒)株或一种微生物中的单一血清型菌(毒)株的增殖培养物所制备的疫苗称为单价疫苗。单价苗对相应的单一血清型微生物所致的疾病有良好的免疫保护效能。
8、多价疫苗。指同一种微生物中若干血清型菌(毒)株的增殖培养物制备的疫苗。多价疫苗能使免疫动物获得完全的保护。
9、多联苗。指利用不同微生物增殖培养物，根据病性特点，按免疫学原理和方法，组配而成。接种动物后，能产生对相应疾病的免疫保护，可以达到一针防多病的目的。
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