新冠肺炎(新冠肺炎武汉肺炎)已经在世界范围内广泛传播了一年，已经有数亿人被感染。大部分人感染后不久，入侵的SARS II冠状病毒(新型冠状病毒)就被成功消灭，而少数人拖了很久，甚至几个月。
长期被感染的英国病人提供了病毒进化的有价值的线索。图/alamy
免疫力低落，长期感染的患者
追踪病毒如何进化，兼具学术和应用价值。一个长期感染的患者，体内来源于病毒的遗传多样性丰富，相互之间竞争激烈，同时也受到抗体治疗的影响。这个罕见的案例向我们展示了病毒进化和适应的可能性。
这位生活在英国的老师在2012年被确诊为淋巴瘤，接受了化疗，并患有B细胞和T细胞缺乏等免疫缺陷。她是瘟疫下的高危人群。2020年夏天，他感染了SARS型冠状病毒，在第102天因多器官衰竭去世。[1]
他一开始感染的病毒应该只有一个来源，除了刺突蛋白常见的D614G突变(Spike(D614G))，没有什么值得一提的特殊之处。
遗传变异的表现为：蛋白质名称(原氨基酸、突变位置、改变的氨基酸)。例如，刺突(D614G)是指刺突蛋白上的第614个氨基酸，由天冬氨酸(D)变为甘氨酸(G)。在不同的日期，他的Ct值从16到34不等，直到他去世，他体内仍有病毒。对比23个时间点，对口鼻检查获得的样本进行基因测序，让我们有机会追踪同一个人长期感染下病毒进化的有价值信息。
具有不同遗传特征的病毒的比例在不同的日期发生变化。起伏相当剧烈。图/[
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