本文向您展示了如何在GWAS分析中处理协变量。内容简洁易懂，一定会让你大放异彩。希望通过这篇文章的详细介绍，你能有所收获。
00-1010在回归分析中，有时需要知道各个因素在各个层面的回归系数，因此需要将因素转化为虚拟变量。R语言有一个model.matrix可以转换，但是只能转换一个因子。在这里，我们使用R包有用，支持多因素同时转换。
1. 背景
牧群c(1，1，2，2，2，3，3，3，3)
年份=c(代表(c(2018，2019)，各=4)，2020)
Sire - c('ZA '，' AD '，' BB '，' AD '，' AD '，' CC '，' CC '，' AD '，' AD ')
收益率- c(110，100，110，100，100，110，110，100，100)
数据帧(畜群、年份、公畜、产量)
数据元从众因素
基准年(基准年)
数字式录音带(digital audio tape)DOS文件名数据文件
这里，牧群、年份、公畜都是因子，在构建矩阵时需要转化为虚拟变量。
00-1010一个因子，一个因子转换，然后合并：
X1=model . matrix(~ Head-1，data=dat)
X1
X2=模型矩阵(~第1年，数据=数据)
X2
X=cbind(X1，X2)
X
2. 示例数据
#简单方法
# install.packages('有用')#如果没有安装有用的包，请运行此命令进行安装。
图书馆(有用)
build.x(~Herd Year-1，数据=dat，对比度=F)
00-1010 #样本数据
牧群- c(1，1，2，2，2，3，3，3，3)
年份=c(代表(c(2018，2019)，各=4)，2020)
Sire - c('ZA '，' AD '，' BB '，' AD '，' AD '，' CC '，' CC '，' AD '，' AD ')
收益率- c(110，100，110，100，100，110，110，100，100)
数据帧(畜群、年份、公畜、产量)
数据元从众因素
基准年(基准年)
数字式录音带(digital audio tape)DOS文件名数据文件
# R中的模型.矩阵
X1=model . matrix(~ Head-1，data=dat)
X1
X2=模型矩阵(~第1年，数据=数据)
X2
X=cbind(X1，X2)
X
#简单的方法
图书馆(有用)
build . x(~ herdyer-1，data=DAT，Contrasts=f)以上内容是GWAS分析中如何处理协变量。你学到什么知识或技能了吗？如果你想学习更多的技能或丰富你的知识，请关注行业信息渠道。
内容来源网络，如有侵权，联系删除，本文地址：https://www.230890.com/zhan/141702.html