本期，边肖将给大家带来KEGG基因组数据库的原理。文章内容丰富，从专业角度进行分析和描述。看完这篇文章，希望你能有所收获。
kegg基因组由三个数据库组成：生物体、选定病毒和元基因组。
Kegg生物体数据库包含具有完整基因组序列的物种信息。对于每个物种，有两种表示：
三个字母或四个字母的物种代码称为组织代码。比如，人对应的组织编码是HSA，鼠标对应的组织编码是mmu。
T数，对于生物中的所有物种，开头都是T0，比如人类对应的T数是T01001
以人类为例，链接是
http://www.kegg.jp/kegg-bin/show_organism?org=hsa
生物体数据库记录以下信息：
除了T号、组织编码等基础信息外，还包括分类学等其他信息。在这些详细的信息中，数据源代表基因组序列的源数据库，通常是Refseq或Genebank原始数据库是另一个物种特定的数据库。单击蓝色单词跳转到相应的数据库。其实这就是综合数据库的价值所在。你只需要在综合数据库中浏览，就知道与这个物种相关的数据库有哪些，就可以轻松跳转到感兴趣的数据库。
精选病毒数据库包含与人类或植物病理学相关的病毒信息，不同的病毒通过T数进行区分。所有病毒的T数以T4开头，如T40218。
http://www.kegg.jp/dbget-bin/www_bget?gn:T40218
病毒数据库还将提供病毒宿主和相关疾病等详细信息。
宏基因组数据库包含了一些关于环境微生物的信息，主要包括口腔、肠道、空气、皮肤和泌尿生殖系统，其中大部分是口腔和肠道微生物。对于环境微生物，每个物种的T数从T3开始。
kegg官网提供的基因组数据库示意图如下：
Kegg为生物数据库中的物种提供了一个简单的分类系统，不同于NCBI的分类数据库。
00-1010 Kegggenome数据库存储物种信息，由生物、病毒、宏基因组三个数据库组成。
每个物种都由T Number唯一识别，生物中的所有物种都从T0开始，病毒中的物种从T4开始，元基因组中的物种从T4开始。
Kegg有一个相对简单的物种分类系统，叫做kegg分类法，它不同于ncbi分类法。
上面边肖分享的KEGG基因组数据库的原理是什么？如果你恰好也有类似的疑惑，可以参考上面的分析来理解。想了解更多，请关注行业信息渠道。
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