KEGG Module数据库的原理是什么？针对这个问题，本文详细介绍了相应的分析和解答，希望能帮助更多想要解决这个问题的小伙伴找到更简单易行的方法。
功能相同的基因分为Kegg或哲学，每个KO代表一种特定的功能。在生命活动中，往往需要多个功能单位协同工作，例如多个蛋白质形成复合物发挥调节作用，然后多个KOs整合在一起。这个例子说明了KO上面一定有一个分类系统，把同一流程涉及的多个KO划分在一起。实际上，KEGG Module数据库就是存储这些信息的数据库。
kegg module数据库中的每一条记录都代表一个功能单元，该功能单元是KOs的集合，称为KEGG Module，由大写字母M和数字标识。
模块数据库包含以下四类功能：
路径模块
结构复合体
功能集
签名模块
更详细的分类信息可以在brite数据库中找到，见以下链接。
http://www.kegg.jp/kegg-bin/get_htext?ko00002 .桶
类似于pathway，对于每个模块记录，都有一个对应的图片叫做模块图。
对应M0002的映射如下
结合它的详细信息，让我们了解一下模块的组成。
从Definition字段的信息中，我们可以看到每个Module都有多个KOs，那么这些KOs之间是什么关系呢？让我们从定义字段的定义开始！
用空格分隔的每个字段称为一个块，M0002可以分为以下五个主要块。
K01803
((K00134，K00150) K00927，K11389)
(K01834、K15633、K15634、K15635)
K01689
(K00873，K12406)
这里，空格表示逻辑AND和AND之间的关系，表示这五个块协同工作；
在(k01834，K15633，K15634，K15635)块中，逗号代表逻辑OR OR的关系，任何KO都可以起到这个blcok的作用。
请注意，逗号和空格都出现在((K00134，K00150) K00927，K11389)中，括号用于正确区分它们。括号中有一个块，所以K00134和K00150是一个块，这个块和K00927之间用空格隔开，所以是一个AND关系，逗号连接两个块(K00134，K00150) K00927和K11389。所以这个区块对应的地图如上图所示。了解了定义字段的信息后，不难发现这个模块对应的地图可以根据这个字段的信息进行计算。
除了空格和逗号，定义也会出现。例如((K01878 K01879)、K14164、K01880)，加号表示两个KOs作为一个块一起工作，对应的映射如下
减号表示可选，表示该块是可选的。例如k 01866k 01873-k 07587-k 11627-k 01884。尽管减号连接块是可选的，但它仍会出现在地图中。
既然模块是从KO发展而来，那么模块也是一个跨物种的概念。对于每个物种，也有一个对应该物种的模块，例如人类中M0000的对应记录为hsa _ M00002；
在物种模块中，根据包含的区块数量可以分为两类。
完整模块，包含引用模块中的所有块；
模块不完整，只缺少一两个块；
在该物种对应的模块图中，该物种对应的KO将被高亮显示。
00-1010 KeggModule数据库是KOs的集成，每个模块代表一个功能单元，是多个KOs的集合；
该模块由模块组成。定义字段中的信息需要理解空格、逗号、加号和减号的不同含义。可以根据定义字段中的信息计算模块映射。
3 .模块是一个跨物种的概念。最初的一个叫做引用模块，它定义了块的数量。根据包含块的完整性，物种对应的模块可以分为完整模块和不完整模块。在与物种相对应的模块图中，相应的KO将被高亮显示。
关于KEGG模块数据库原理问题的答案，希望在这里分享
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